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毛細管電泳技術助力宏基因組測序
來源: | 作者:201321492800086 | 發布時間: 43天前 | 157 次瀏覽 | 分享到:
在人類的歷史中,人們經常會受到各種傳染病的困擾,可以說人類發展史同時也是人類與傳染病斗爭的歷史。診斷、治療和預防是人類與傳染病斗爭的三個關鍵環節。其中,最為關鍵的是及時正確診斷,在正確診斷的基礎上才能夠進行有效的治療,制定有效的預防策略。及時發現、有效鑒別、快速診斷和提出預警,這是現代最前沿的傳染病防治體系。

在人類的歷史中,人們經常會受到各種傳染病的困擾,可以說人類發展史同時也是人類與傳染病斗爭的歷史。診斷、治療和預防是人類與傳染病斗爭的三個關鍵環節。其中,最為關鍵的是及時正確診斷,在正確診斷的基礎上才能夠進行有效的治療,制定有效的預防策略。及時發現、有效鑒別、快速診斷和提出預警,這是現代最前沿的傳染病防治體系。


在臨床感染性病原體探尋的過程中,臨床醫生時常會面對新發病原體想不到、疑難感染病原體沒想到、或者由于檢測技術受限想到沒檢測到的困境,現有的臨床輔助診斷方式與臨床的迫切需求之間還存在著巨大的鴻溝。而基于宏基因組新一代測序技術(metagenomics next generation sequencing, mNGS) 不依賴于傳統的微生物培養,直接對臨床樣本中的核酸進行高通量測序,能夠快速、客觀的檢測臨床樣本中的多種病原微生物(包括病毒、細菌、真菌、寄生蟲),尤其適用于急危重癥和疑難感染的診斷。隨著mNGS 技術平臺的完善和臨床研究的增多,mNGS在臨床上的運用將越來越廣泛。mNGS的適時使用,可以準確快速的幫助臨床明確患者發熱病因,推動臨床的精準診斷。


而在本次新型冠狀病毒疫情的爆發中,基因測序為我們確定病原體,及時研發診斷試劑盒做出了很大的貢獻。基因測序對動態監控病毒的變異也意義重大。針對新冠病毒宏基因組測序樣品,我們的Qsep系列全自動核酸蛋白分析系統采用毛細管電泳的技術,可以為您提供從RNA和cDNA完整性質控到文庫質控的全自動解決方案,助您完成高通量的mNGS文庫實驗,得到良好的測序結果。


對于RNA 的質控,可根據直觀的RQN (RNA quality number)值來判斷樣本的質量,RQN 值越接近于10 Total RNA質量越好(見圖1)。RNA質控合格后,即可進行下一步的實驗。逆轉錄得到的cDNA同樣也需要進行質控,來判斷得到cDNA的大小是否合適(見圖2)

圖1  RNA 的質控(Qsep結果圖)

圖2  cDNA的質控(Qsep結果圖)

在得到的文庫之后,需要檢測接頭殘留情況,以及文庫的片段大小是否合適,在質控合格后,就可以上測序儀進行測序了(見圖3)。Qsep系列全自動核酸蛋白分析系統采用現在興起的全自動毛細管電泳,可以較低的成本完成對樣本的質控,且分辨率和靈敏度都很高,可如實反應樣本的真實情況,是現在NGS公司在核酸質控方面值得考慮的一款儀器。

圖3  文庫的質控(Qsep結果圖)

 
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